Il quinto volume comprende i capitoli dominati dalle figure di Pasteur e Darwin. I primi, che illustrano gli studi sulle fermentazioni, sull'enologia, sulle malattie del baco da seta, sulle malattie infettive dei quadrupedi e dei polli, fino alle ricerche sulla rabbia, compongono una delle analisi più dettagliate dell'opera del fondatore della microbiologia tra quante proposte dalla storia della scienza. Chiave di lettura, il proposito di confutare gli storici che hanno contestato a Pasteur la mancanza di principi teorici adeguati a spiegare l'insieme dei fenomeni che affronta, un appunto che il testo dissolve dimostrando il rigore dei criteri conduttori che ne ispirano tutte le ricerche. Anche i capitoli dedicati a Darwin assolvono ad un proposito epistemologico, affrontando la lettura sistematica dell'opera maggiore, per mole, La variazione degli animali e delle piante allo stato domestico, che gli studiosi del naturalista britannico, fissi all'"Origine delle specie" per mezzo dell'elezione naturale, hanno trascurato, mancando di cogliere il carattere complementare che essa riveste rispetto alla prima.
